Dvimatės elektroforezės gelių vaizdų parametrizavimo ir katalogavimo sistemos kūrimas
Remia: Lietuvos valstybinis mokslo ir studijų fondas
Tipas: Mokslininkų grupių projektas
Registravimo Nr.: T-08126
Sutarties Nr.: T-111/08
Sritis: Informatikos inžinerija - 07T
Vadovas: prof. Dalius Navakauskas
Nariai: prof. R. Martavičius, dokt. A. Serackis, dokt. D. Matuzevičius
Laikotarpis: 2008.01.01-2008.12.31
Parama: 30.000 Lt
Šio projekto tikslas - sukurti ir ištirti dvimatės elektroforezės gelių informacinės sistemos prototipą, grindžiamą dirbtinio intelekto taikymu, siekiant kataloguoti gelių vaizdus, rasti šiuose geliuose esančius baltymus bei įvertinti ir kataloguoti baltymų parametrus.
Projekto metu:
1. Tiriamas dirbtinių neuronų tinklų pagrindu veikiančių algoritmų tinkamumas baltymų pėdsakų, esančių dvimatės elektroforezės gelių vaizduose, greitam bei tiksliam nustatymui.
2. Parenkamos bei modernizuojamos dirbtinių neuronų tinklų struktūros bei jų mokymo algoritmai kuriant specializuotas priemones baltymų pėdsakams apdoroti.
3. Kuriamas ir tiriamas dvimatės elektroforezės gelių informacinės sistemos prototipas parodant sukurtų originalių intelektualiųjų modelių tinkamumą.
Proteomika
Proteomika – tai mokslo sritis, tirianti proteomą – visus baltymus, esančius ląstelėje arba organizme tam tikru metu, įskaitant ne tik tuos, kurie yra susintetinti organizme pagal jo genetinę informaciją, bet ir daugybę modifikuotų, atsiradusių po potransliacinių procesų, dėl išorinio arba vidinio ląstelės signalo perdavimo, kas pakeičia baltymo funkciją ar aktyvumą. Skirtingai nei genomas, proteomas yra dinamiškas, atspindintis tūkstančius tuo metu perduodamų signalų ląstelės viduje ir išorėje.
Proteomika tiria proteomus skirtingomis sąlygomis – kintant laikui, aplinkai ar įvairiose ligos stadijose. Kadangi baltymai yra pagrindiniai dalyviai ląsteliniuose procesuose, tai jų visumos (proteomo) tyrinėjimas yra pagrindas, aiškinantis globalius procesus organizme.